Biopsija podrazumeva uzimanje uzoraka tkiva štitaste žlezde. Tokom procedure lekar uzima uzorak tkiva iglom ili skalpelom. Tkivo se ispituje mikroskopski i pregleda na prisustvo karcinoma, prekanceroznih ćelija i ostalih patoloških promena Biopsija generalno nije bolna, ali može se osetiti neugodnost. Biopsija je jedini način da se odredi da li je promena dobroćudne ili zloćudne prirode.